Основателем и первым директором центра была Вера Ивановна Тюрюханова (Буторова). Благодаря высокому профессионализму, Вере Ивановне удалось создать сплочённую команду профессионалов, знающих своё дело, любящих детей и свою профессию. Большинство из них работает в центре и сегодня.

Немалую роль в становлении и дальнейшем развитии центра сыграл Забайкальский национальный парк. При поддержке парка проводился первый полевой  экологический лагерь, специалисты парка участвовали в разработке и проведении образовательных программ, в реализации природоохранных проектов.

 В 1997 г. станция была реорганизована в самостоятельную организацию – Центр детского экологического образования «Подлеморье», который значительно расширил границы своей деятельности. В это время появились новые  объединения естественнонаучной направленности, такие  как «Лесная школа», «Байкаловедение», «Экология посёлка». Организация учебно-исследовательской, проектной, практической природоохранной деятельности по экологическому образованию  становится приоритетным направлением деятельности центра.  

В целях реализации Федерального закона от 08.05.2010 года № 83- ФЗ «О внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации в связи с совершенствованием правового положения государственных (муниципальных учреждений)»  учреждение приобрело статус муниципального бюджетного учреждения дополнительного образования детей. В связи с расширением направлений в реализации дополнительных общеобразовательных программ, было изменено наименование учреждения и экоцентр стал «Центром дополнительного образования детей «Подлеморье».